Tim Penjaminan Mutu Fakultas(TPMF) Perikanan dan Ilmu Kelautan merupakan tim khusus yang memiliki garis koordinasi dibawah Dekan dan Pembantu Dekan. Tugas dari tim ini adalah Dalam menjalankan tugasnya, TPMF  dibantu oleh Gugus Penjaminan Mutu (GPM) pada masing-masing program studi. Tugas dari GPM adalah untuk mempersiapkan instrument penjaminan dan pengambangan mutu bagi masing-masing jurusan/ program studi